Kế hoạch sản xuất nhóm nhạc có tên HKT48 được nhà sản xuất của AKB48 Akimoto Yassushi tiết lộ vào ngày 19 tháng 11 năm 2008.[1] HKT48 đã chính thức được công bố ngày 1/5/2011 tại sự kiện bắt tay của AKB48.[4] Đây là nhóm chị em thứ tư của AKB48 được ra mắt chỉ sau SKE48, SDN48 và NMB48.[2] Nhóm được lấy tên từ trụ sở chính Hakata-ku, Fukuoka.[1] Thay vì trước đó nhắm mục tiêu vào Hakata-ku, thay vào đó nhóm sẽ được đặt tại nhà hát Hawkd Town Mall ở lân cận.[2] Vị trí này nằm cạnh Fukuoka Yahoo! Japanese Dome.[5] Ngoài ra, nhóm đã được thông báo rằng sẽ chấp nhận tuyển dụng các cô gái tuổi từ 11 đến 22.[4] Buổi thử giọng đầu tiên của HKT48 diễn ra vào ngày 31/5/2011, và các ứng cử viên thành công sẽ tiếp tục buổi thi kế tiếp bao gồm 1 bài kiểm tra ca hát và nhảy múa trong nữa đầu tháng 7/2011.[4] Buổi thử giọng cuối cùng được tổ chức tại Hilton Fukuoka Sea Hawk Hotel vào ngày 10 tháng 7 và 24 thí sinh đã vượt qua bài thi cuối cùng.[6]

Sau khi trải qua các bài học về vũ đạo và thanh nhạc, 21 thành viên đầu tiên của HKT48 lần đầu tiên được tiết lộ tại một sự kiện bắt tay AKB48 vào ngày 23 tháng 10 năm 2011 tại Seibu Dome.[5] Trong số 21 thành viên,có 17 người là học sinh trung học cơ sở và 2 người là học sinh tiểu học.[7] Thành viên trẻ nhất của nhóm, Natsumi Tanaka sinh năm 2000 khoảng 11 tuổi vào thời điểm thông báo. Cô ấy nói rằng "Tham gia buổi thử giọng là vì ước mơ của tôi kể từ khi tôi 5 tuổi, vì vậy tôi cảm thấy ước mơ đã thành sự thật khi tôi được vào nhóm."[7] Thành viên lớn tuổi nhất là Yūko Sugamoto, 17 tuổi vào thời điểm thông báo.[5]

Họ ra mắt tại Nhà hát HKT48 vào ngày 26 tháng 11 năm 2011,[8] và đã thực hiện bài hát mang tên "Te o Tsunaginagara", ban đầu được thực hiện bởi SKE48 Team S và KII. Vào ngày 31 tháng 12 năm 2011, 16 thành viên đã xuất hiện trên sân khấu "NHK Kōhaku Uta Gassen" lần thứ 62, là một trong những nhóm chị em của AKB48.[9] Vào ngày 4 tháng 3 năm 2012, 16 thành viên đầu tiên được chọn để tham gia và xuất hiện trên sân khấu của HKT48.[10] Vào ngày 20 tháng 6 năm 2012, Rino Sashihara từ AKB48 được chuyển sang HKT48 và hiện là thành viên hoạt động lâu nhất của HKT48.[11]

Vào ngày 23 tháng 6 năm 2012, các cuộc thử giọng cuối cùng cho Gen2 đã được tổ chức, và 34 ứng cử viên trong tổng số 48 thí sinh đã vào vòng cuối cùng.[12] Vào ngày 18 tháng 8 năm 2012, ban quản lý đã thông báo rằng năm thành viên, 3 thành viên của đội H Komori, Sugamoto và Taniguchi, và 2 Kenkyusei Eto và A. Nakanishi, sẽ tốt nghiệp khỏi HKT48 "vì lý do cá nhân".[13] Vào ngày 24 tháng 8 năm 2012, nhóm được công bố vào ngày đầu tiên của concert AKB48 tại Tokyo Dome cụ thể là Aika Ota một thành viên của AKB48 Team A, sẽ được chuyển đến HKT48.[14] Vào ngày 23 tháng 9 năm 2012, ứng cử viên Gen2 của HKT48 đã được công bố.[15]

HKT48 phát hành single đầu tay của họ, "Suki Suki Skip!" vào ngày 20 tháng 3 năm 2013 theo Universal Sigma.[16][17]

Vào ngày 31 tháng 3 năm 2016, nhà hát hiện tại nằm ở Hawks Town Mall đã đóng cửa, với một buổi biểu diễn chia tay đặc biệt. Một nhà hát mới được khai trương tại Nishitetsu Hall, vào ngày 28 tháng 4 năm 2016.[3]